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Margriet Palm

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Computational biologist at #LACDR @UniLeiden (previously @INRIA, @CWInl), fascinated by biology, crazy about python and loves music.

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    Margriet Palm‏ @margrietpalm 15 giu

    @wdeback is the windows binary for Morpheus at https://imc.zih.tu-dresden.de/wiki/morpheus/doku.php?id=download:download … the most recent one?

    00:43 - 15 giu 2017
    2 risposte 0 Retweet 0 Mi piace
      1. Nuova conversazione
      2. Walter de Back‏ @wdeback 15 giu
        In risposta a @margrietpalm

        Updated Windows binaries for Morpheus are now available. Have fun! https://imc.zih.tu-dresden.de/morpheus/packages/windows/public/morpheus-1.9.Windows.b170615.exe …

        1 risposta 0 Retweet 2 Mi piace
      3. Margriet Palm‏ @margrietpalm 19 giu
        In risposta a @wdeback

        Binary is working fine and seems to 10 to 30% faster. However, cpm+2D diffusion is still about a factor 10 faster on linux.

        0 risposte 0 Retweet 0 Mi piace
      4. Fine della conversazione
      1. Nuova conversazione
      2. Walter de Back‏ @wdeback 15 giu
        In risposta a @margrietpalm

        No, it's not. Latest Linux/OSX binaries date from 05.05.17, but Windows version lacks behind (latest 02.11.16): https://imc.zih.tu-dresden.de/morpheus/packages/ …

        1 risposta 0 Retweet 0 Mi piace
      3. Walter de Back‏ @wdeback 15 giu
        In risposta a @wdeback e @margrietpalm

        Thanks for the comment. We'll update the Windows binary.

        1 risposta 0 Retweet 0 Mi piace
      4. Walter de Back‏ @wdeback 15 giu
        In risposta a @wdeback e @margrietpalm

        However, due to lack of compiler-level optimizations, performance of the Windows version is noticeably lower. I strongly advice Linux/Mac.

        2 risposte 0 Retweet 0 Mi piace
      5. Margriet Palm‏ @margrietpalm 15 giu
        In risposta a @wdeback

        I just noticed that; factor 10 for a simulation with diffusion on 300x300 grid :'(.

        0 risposte 0 Retweet 0 Mi piace
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