Wenn wir die Fragmentsportler jetzt noch schneller hin und her rennen lassen, wer wird dann als erster nicht mehr mitkommen können?
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Richtig, die etwas adipöseren Peptidfragmente. Die fliegen aus der Ionenfalle raus.
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Das können wir messen. Wir wissen auch bei welcher Wechselfrequenz es rausgeflogen ist.
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Praktischerweise ist die Wechselfrequenz proportional zu Masse und Ladung des Fragments.
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Aus Fairnessgründen treiben wir die Wechselfrequenz so weit hoch, dass irgendwann auch die ganz leichten Fragmente rausfliegen.
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Jedes Mal detektieren wir das völlig erschöpfte Fragment und bestimmen dessen Masse aufgrund der aktuellen Wechselfrequenz.
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Graphisch kann man das dann so darstellen.pic.twitter.com/paTrdt2FaO
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Ganz rechts das schwerste Fragment, links das leichteste.
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Natürlich stehen da nicht die Sequenzen drüber… Aber man kann draufkommen, da die Aminosäuren unterschiedlich schwer sind.
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So können wir von jedem Peptid und damit von jedem Protein, denn daher kommen die Peptide, die Sequenz bestimmen. Identifikation
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Und dann weiss wieder keiner, wie die jetzt gefaltet gehören!
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Replying to @andreasdotorg
Oh, guter Punkt. Das thematisieren wir morgen mal noch. Danke!
0 replies 0 retweets 3 likesThanks. Twitter will use this to make your timeline better. UndoUndo
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