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Adam Kucharski

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Mathematician/epidemiologist at @LSHTM. @WellcomeTrust fellow and @TEDFellow. Author of The Rules of Contagion: http://kucharski.io/books/ 

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    Adam Kucharski‏ @AdamJKucharski 19. Feb.
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    Our updated @cmmid_lshtm pre-print (now in press) estimates that R in Wuhan declined from 2.4 (95% CI:1.2-4.8) to 1.1 (0.41-2.4) in last two weeks of Jan. (Note: we didn't use recent case counts from Wuhan, just early data and exported cases/infections) https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.01.31.20019901v2 …pic.twitter.com/ScVOFtQydU

    14:12 - 19. Feb. 2020
    • 53 Retweets
    • 116 „Gefällt mir“-Angaben
    • Ilan FR Geoff Millikan Diego van Esso Sam Abbott Ryan Kanno Pruna SIAECM Thibaut Jombart Librix
    11 Antworten 53 Retweets 116 Gefällt mir
      1. Neue Unterhaltung
      2. Adam Kucharski‏ @AdamJKucharski 19. Feb.
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        It wasn't possible to estimate the direct impact of specific control measures from available data (behaviour change is also likely to be a factor), but does suggest a big reduction in transmission coinciding with late Jan interventions.

        1 Antwort 2 Retweets 8 Gefällt mir
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      3. Adam Kucharski‏ @AdamJKucharski 19. Feb.
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        We can't estimate R precisely for more recent days unless we rely on the Wuhan case data, which has a lot of uncertainty around it - the recent decline in confirmed cases would give an R<1 estimate, but we aren't confident yet that this is a robust signal.

        1 Antwort 2 Retweets 10 Gefällt mir
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      4. Adam Kucharski‏ @AdamJKucharski 19. Feb.
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        Our results provide some initial evidence that R was down to around 1 by the end of Jan. The key question, which we're currently investigating, is whether it has since dropped below this crucial value.

        1 Antwort 1 Retweet 16 Gefällt mir
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      5. Adam Kucharski‏ @AdamJKucharski 19. Feb.
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        Adam Kucharski hat Adam Kucharski retweetet

        Early data on growth in cases outside China also suggests an 'under control' value of R~1, so we may be seeing initial evidence of an upper bound for the effectiveness of widespread control measures.https://twitter.com/AdamJKucharski/status/1229374844770361344?s=20 …

        Adam Kucharski hat hinzugefügt,

        Adam Kucharski @AdamJKucharski
        Despite widespread containment efforts, we’re currently seeing evidence of growth in cases outside China consistent with R~1. Of course, also very important to consider underreporting & local variation in transmission - some areas may have higher R. https://twitter.com/HelenBranswell/status/1229142332999700480 …
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        4 Antworten 3 Retweets 23 Gefällt mir
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      6. Ende der Unterhaltung
      1. Tytti Laiho‏ @TyttiLaiho 20. Feb.
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        Antwort an @AdamJKucharski @cmmid_lshtm

        They ran out of test kits. Use CT for diagnosing. I hope the figures are right.

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      1. epsilon‏ @epsilon3141 20. Feb.
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        Antwort an @AdamJKucharski @JustinLessler @cmmid_lshtm

        Thanks. In your previous work https://cmmid.github.io/ncov/wuhan_early_dynamics/index.html … eventual reduction in transmission was attributed to mounting herd immunity, not to control measures, if I interpret Figure 1C correctly ? So your new work is encouraging sign that control or even containment is possible.

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      1. epsilon‏ @epsilon3141 20. Feb.
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        Antwort an @AdamJKucharski @JustinLessler @cmmid_lshtm

        Question re. Fig. 1G x-axis is predicted/modelled number of exports. i.e. a proxy for the 'real' number of exports. But shouldn't the y-axis as "detected" exports be only a fraction of actual exports (unless there is 100% ascertainment) so the regression slope should be < 1?

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      1. Neue Unterhaltung
      2. Saved_by_His_Amazing_Grace‏ @BozhanovaVer 19. Feb.
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        Antwort an @AdamJKucharski @cmmid_lshtm

        What is R?

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      3. Physical Attraction, Physics Podcast‏ @physicspod 19. Feb.
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        Antwort an @BozhanovaVer @AdamJKucharski @cmmid_lshtm

        R is the average number of people that each infected person goes on to infect. So an R of 2 means every infected person will infect two more people on average. R > 1 means that an epidemic will grow. R < 1 means it will eventually shrink. Control measures aim to reduce R

        1 Antwort 2 Retweets 5 Gefällt mir
      4. 2 weitere Antworten
      1. Its a CULT‏ @stephen_pearce 19. Feb.
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        Antwort an @AdamJKucharski @cmmid_lshtm

        Mizumoto article on 2/13 indicated R of 7. Do you believe R went from 7 to 2.4, or is difference due to calculation/assumptions? Do you have opinion/estimate on R w/o control measures?

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